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しかし生体内にはペプチド結合のみを選択的に加水分解する酵素ペプチダーゼ、プロテアーゼが存在し、これらの中には中性に近い生物の体温程度の温度でかなり迅速にペプチド結合を加水分解することができるものもある。関連項目ペプチド独:Peptid英:peptideギリシャ語のπεπτο?消化できるに由来するは決まった順番で様々なアミノ酸がつながってできた分子の系統群である。一つのアミノ酸残基と次のそれの間の繋がりはアミド結合またはペプチド結合と呼ばれる。アミド結合は典型的な炭素・窒素単結合よりもいくらか短い、そして部分的に二重結合の性質をもつ。なぜならその炭素原子は酸素原子と二重結合し、窒素は一つの非共有電子対を結合へ利用できるからである。ペプチドはリボソームペプチド、非リボソームペプチド、消化ペプチドの3つに大別される。
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